Cụ thể, đối với thuốc kháng virus chưa được Tổ chức Y tế Thế giới (WHO) khuyến cáo sử dụng, chưa được cấp phép lưu hành, chưa được cấp phép sử dụng khẩn cấp tại bất kỳ quốc gia nào trên thế giới, yêu cầu việc sử dụng phải tuân thủ các quy định về thử nghiệm lâm sàng của Bộ Y tế. Với thuốc kháng virus đã được WHO khuyến cáo sử dụng hoặc được cấp phép lưu hành, hoặc được cấp phép sử dụng khẩn cấp tại ít nhất 1 quốc gia trên thế giới thì có thể được chỉ định điều trị theo diễn biến bệnh lý của người bệnh.

Trong đó, thuốc kháng virus Remdesivir dành cho bệnh nhân nội trú, mức độ trung bình và nặng, khởi phát bệnh chưa quá 10 ngày có suy hô hấp phải thở oxy, thở oxy lưu lượng dòng cao (HFNC), hoặc thở máy không xâm nhập; nên phối hợp với Corticoid (ưu tiên Dexamethason); ưu tiên sử dụng thuốc cho nhóm nguy cơ cao như người bệnh trên 65 tuổi, người có bệnh nền, người bệnh béo phì (BMI > 25); không nên bắt đầu sử dụng cho người bệnh Covid-19 cần thở máy xâm nhập, chạy ECMO (trường hợp đã được điều trị bằng Remdesivir trước khi thở máy xâm nhập hoặc ECMO thì có thể tiếp tục dùng Remdesivir cho đủ liệu trình). Chống chỉ định cho người có tiền sử quá mẫn với bất kỳ thành phần nào trong công thức thuốc; suy giảm chức năng thận (mức lọc cầu thận ước tính eGFR < 30 mL/phút); tăng enzym ALT > 5 lần giá trị giới hạn trên của khoảng giá trị bình thường.

Thuốc kháng virus Favipiravir 200mg dành cho bệnh nhân Covid-19 mức độ nhẹ, trung bình; chống chỉ định cho PNCT, phụ nữ đang có kế hoạch có thai, người dưới 18 tuổi, người uy gan nặng, suy thận nặng và phụ nữ cho con bú. Riêng với thuốc kháng virus Molnupiravir, tất cả chỉ định, chống chỉ định, liều dùng theo thuyết minh đề cương thử nghiệm lâm sàng đã được phê duyệt.